根据《中华人民共和国劳动合同法》相关规定，为您分析公司罚款50万的法律依据适用情况：
《中华人民共和国劳动合同法》第四条规定：“用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。”
若公司对员工请假罚款50万，但未提供经过民主程序制定并公示的规章制度作为依据，或规章制度中未明确请假罚款的具体标准，则违反上述法律规定。此外，即使有规章制度，50万的罚款金额远超员工正常月工资，明显不合理，也不符合法律对用人单位工资扣除的限制性原则。因此，公司罚款50万的行为缺乏合法依据。
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公司因请假罚款50万时，需避免以下常见错误操作行为：
1. 忽视证据收集：部分员工发现被罚款后，未及时收集请假记录、工资条等关键证据，导致后续维权时因证据不足而无法证明公司的违法事实。
2. 直接与公司发生激烈冲突：有些员工在得知被罚款50万后，情绪激动，与公司管理层或人力资源部门发生争吵甚至肢体冲突，不仅不利于问题解决，还可能因违反公司规章制度而被公司进一步处罚。
3. 超过维权时效：劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。若员工超过时效才申请仲裁，可能丧失胜诉权。
若您已出现上述错误操作，或担心维权过程中出现其他问题，建议尽快向律师咨询，以便及时采取补救措施。
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以下特殊情况或例外情形可能会影响公司因请假罚款50万的处理结果：
1. 员工请假系因紧急情况且未及时按规定程序申请，但事后已补正相关手续：若员工因突发疾病、家有急事等紧急情况请假，未提前按公司规定的程序提交申请，但事后及时向公司说明情况并补正了请假手续，公司仍罚款50万，则该罚款行为的合法性会受到质疑。劳动仲裁或法院可能会认定公司的罚款缺乏合理性，支持员工要求退还罚款的请求。
2. 公司规章制度中虽有请假罚款规定，但该规定未经过职工代表大会或全体职工讨论：根据《劳动合同法》第四条，公司规章制度需经民主程序制定。若公司的请假罚款规定仅由管理层单方面制定，未经过职工代表大会或全体职工讨论，也未与工会或职工代表协商，则该规定不具备法律效力。在此情况下，公司依据该规定罚款50万的行为无效，员工可依法维权。
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员工请假公司罚款50万是否合法，需结合具体情况判断。以下为您分析不同情形下的合法性：
1. 若公司规章制度未明确规定请假罚款，或该规章制度未经过民主程序制定并公示，则罚款50万不合法。
2. 若公司规章制度虽规定请假罚款，但罚款金额远超员工月工资的合理比例（如超过月工资的20%），则罚款50万不合法。
3. 若员工请假程序合规，且无严重违反劳动纪律的行为，公司单方面罚款50万不合法。

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